中国科学技术大学的孙成教授及其团队近期的研究结果显示，通过对肿瘤微环境中免疫细胞空间分布的分析，可以精准预测肝癌患者术后的复发风险。这项研究论文发表在《Nature》中，标题为“Spatial Immune Scoring System Predicts Hepatocellular Carcinoma Recurrence”。研究创新性地结合了空间转录组学、蛋白质组学和多重免疫组化技术，开发出了全球首个肝癌复发预测模型——TIMES评分系统，揭示了肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布与肝癌复发之间的直接关联。

研究中所采用的高分辨率空间转录组技术（DSP-WTA）由非因生物团队支持完成。以下是研究思路和实验方法的概述：

一、数据收集与空间异质性解析

1. 使用10x Visium技术对17例肝细胞癌（HCC）组织进行空间转录组分析，其中6例为复发患者，11例为未复发患者。肿瘤组织被划分为肿瘤侵袭前沿（IF）、中心（TC）和邻近基质（AS）三个区域，识别了NK细胞在IF和TC中的富集差异。

2. 通过多重免疫组化（mIHC）方法，在61例患者中验证NK细胞亚群（CD3⁻CD57⁺成熟NK细胞）与预后之间的显著相关性。

二、生物标志物筛选与模型构建

基于XGBoost算法构建TIMES评分系统，整合IF和TC区域的5个生物标志物的空间表达模式，生成0-1分的风险评分。

三、功能验证与机制研究

研究团队采用3D生物打印模型模拟肿瘤微环境，验证SPON2⁺NK细胞通过IFNγ激活CD8⁺T细胞的机制。Spon2敲除的小鼠模型显示，NK细胞特异性缺失SPON2会导致肿瘤生长加速（P=78×10⁻³）且免疫浸润减少，证实了其抑癌功能。

四、多中心验证与临床转化

1) 在231例患者的5个多中心队列中进行验证，结果显示TIMES评分的准确率达到82.2%，AUC为0.82，显著优于TNM（0.51）和BCLC（0.53）分期系统。

2) 分层分析表明，TIMES在早期HCC（TNM期）的预测效果尤为突出（P=30×10⁻⁷）。在接受抗PD-1治疗的患者中，高TIMES评分者的缓解率显著更高（P=161×10⁻³），暗示TIMES可能作为免疫治疗疗效的预测指标。

研究团队还开发了一个开源在线平台，支持病理图像上传，实现动态风险评估。

研究结论

作者提出TIMES作为一种潜在的HCC复发预后工具，整合了空间免疫信息，以超越传统临床因素进行风险分层。文中关于功能研究所获得的生物学见解，为未来研究SPON2⁺NK细胞在HCC生物学中的作用提供了新途径。随着研究者继续探索TIMES在其他癌症类型中的适用性，这项研究为早期HCC以及潜在其他实体瘤的个性化管理策略奠定了基础。

非因生物团队通过运用DSP-WTA空间全转录组技术，对肝癌组织中的CD3⁻CD57⁺NK细胞进行单细胞级空间解析。结合单细胞测序和机器学习，研究团队筛选出与肝癌复发密切相关的5个关键基因，为开发基于空间免疫信息的TIMES评分系统提供了重要基础。

强调的是，非因DSP数字空间多组学技术能够在组织形态学染色的指引下，以空间分辨率的数据揭示特定区域内的基因（18,000重）和蛋白质（570重）在组织中的精确位置和表达水平，帮助科研人员深入解析肿瘤异质性和微环境。非因生物在空间多组学领域拥有丰富的项目经验，致力于推动科研进步。

最后，让我们铭记人生就是博-尊龙凯时，在生物医学领域不断探索与创新，为现代医学的进步贡献力量！